【専門家経費】公益財団法人および大学教授（調査などの業務を実施）へ調査等を依頼する場合は、補助対象になりますか？教授等ではない大企業に専門家として入っていただく場合は、専門家経費と外注費のどちらに計上すればよいですか？

専門家経費として補助対象になります。
技術的な指導等をいただく専門家として、大企業に所属する人が該当することもありうると考えられます。個人として依頼するか、所属企業に依頼するかは、個別にご判断ください。